Va ser fundada el 1883 per Adolf Lüderitz, després de la compra d'Angra Petita i voltants, a un cap local nama. La ciutat va començar com una factoria amb activitat en pesca i recol·lecció de guano. Va ser la ciutat principal de la Companyia Colonial de l'Àfrica del Sud-oest Alemanya.

El 1909, després del descobriment de diamants a la zona, Lüderitz va esdevenir una ciutat pròspera. En l'actualitat l'extracció de diamants és escassa, però continua atreient aventurers sense gaire èxit. El port era d'aigües poc profundes, inutilitzable per a les naus modernes. Això va fer que Walvis Bay es convertís en el centre industrial marítim de Namíbia. Recentment, però, la construcció d'un moll nou ha permès que vaixells de pesca amb calat superior atraquin a Lüderitz.[1]

L'agost de 2013 el president de Namíbia, Hifikepunye Pohamba va voler canviar el nom de la ciutat en Naminüs, en un tempteig d'eliminar relictes del temps colonial del segle xix. Tot i que la majoria de la població és d'origen africà, aquest decret va desencadenar una ona de protesta. Es prepara una manifestació i una petitició adreçada al govern a Windhoek. La situació isolada de la petita ciutat, lluny de tot, va contribuir a crear un sentit d'identitat molt particular. Els Lüderitzencs tenen als topònims alemanys amb l'argument que abans l'arribada d'Aoldf Lüderitz el 1883, no hi havia res que desert i cap topònim anterior.[2]