Muzeum Apartheidu (afrikánsky Apartheidsmuseum) se nachází v Johannesburgu v Jihoafrické republice. Ukazuje a zobrazuje historii JAR od počátků vzniku podmínek pro apartheid, jeho vzestup, kdy docházelo k segregaci černých a jiných obyvatel státu, až po jeho pád. Samostatnou výstavu zde má Nelson Mandela. Muzeum bylo otevřeno v roce 2001 a znovuotevřeno po pandemii covidu-19 v dubnu 2022. Několikrát ročně probíhají tématizované výstavy a akce.

Muzeum vzniklo v souvislosti s projektem výstavby casina. Jeho provozovatel musel podpořit rozvoj instituce, která měla pozitivní společenský dopad a zároveň významný vliv na rozvoj turistiky. Tím vzniklo toto muzeum.