Der See war Schauplatz zweier historischer Ereignisse. Am südwestlichen Ende des Sees bei Acharacle schlugen keltische Stämme unter ihrem Anführer Somerled im Jahr 1140 ein von Torquil angeführtes normannisches Heer. Torquil wurde in der Schlacht getötet und die Normannen für längere Zeit aus dem Gebiet vertrieben.

Auf der St Finan’s Isle im Westteil der Insel befinden sich die Ruinen einer mittelalterlichen Kapelle, die mit dem Clan Ranald verknüpft ist. Möglicherweise ließ sich dort bereits im 7. Jahrhundert ein irischer Missionar nieder, nach dem die Insel benannt ist.[1]

Am nordöstlichen Ende von Loch Shiel befindet sich das Glenfinnan Monument. Es markiert die Stelle, an der sich die Hochlandclans am 19. August 1745 trafen, um angeführt von Bonnie Prince Charlie zum – letztlich erfolglosen – Aufstand der Jakobiten gegen die englische Vorherrschaft anzutreten. Loch Shiel ist daher für schottische Patrioten von besonderer Bedeutung. Einmal im Jahr wird an der historischen Stätte der Ereignisse von 1745 gedacht.