Choquequirao (πιθανόν από μέταλλο chuqi Κέτσουα, κούνια k'iraw, κούνια) είναι μια τοποθεσία των Ίνκας στο νότιο Περού, παρόμοια σε δομή και αρχιτεκτονική στο Μάτσου Πίτσου. Τα ερείπια είναι κτίρια και βεράντες σε επίπεδα πάνω και κάτω από το Sunch'u Pata, την κολοβωμένη κορυφή του λόφου. Η κορυφή του λόφου ήταν αρχαία ισοπεδωμένη και δακτυλιωμένη με πέτρες για να δημιουργήσει μια πλατφόρμα 30 επί 50 μ.

Το Choquequirao σε υψόμετρο 3.050 μέτρων (10.010 ft) βρίσκεται στα άκρα της οροσειράς Vilcabamba στην περιοχή Santa Teresa, στην επαρχία La Convención της περιφέρειας Cusco. Το συγκρότημα είναι 1.800 στρέμματα, εκ των οποίων το 30–40% είναι ανασκαμμένο. Η τοποθεσία έχει θέα στο φαράγγι του ποταμού Apurimac, το οποίο έχει υψόμετρο 1.450 μέτρων (4.760 ft).

Η τοποθεσία είναι προσβάσιμη με μια διήμερη πεζοπορία έξω από το Κούσκο. Ο Choquequirao βρίσκεται στην κορυφή της λίστας με τις κορυφαίες περιοχές του Lonely Planet's Best in Travel 2017.