Las primeras evidencias de ocupación en este asentamiento se remontan al 400 a. C., cuando una comunidad se estableció en un valle en forma de herradura y desarrolló como actividad principal la agricultura, constituyendo una sociedad bien organizada, que levantó edificios monumentales, así como un sistema hidráulico, que les facilitó el riego y el mantenimiento de los inmuebles.

A principios de nuestra era, se instituyó en Edzná un gobierno centralizado, que legitimó su poder político, basado en la supuesta relación de los gobernantes con las deidades, convirtiéndose en una capital regional del occidente de la península, hacia los años 400 -1000 de nuestra era. En la época de máximo auge, Edzná llegó a tener hasta 25000 habitantes, sin embargo, posteriormente, se dio la paulatina decadencia del sitio, hasta su total desocupación, en 1450.