Sveti Jovan Kaneo (makedonski: Свети Јован Канео) je mala i vjerojatno najpitoresknija crkva kod ribarskog sela Kaneo u neposrednoj blizini grada Ohrida, na hridi iznad Ohridskog jezera u Republici Makedoniji.

Crkva je posvećena autoru Evanđelja po Ivanu - sv. Jovanu Teologu (sv. Ivanu evangelistu). Točan datum izgradnje crkve ostaje nepoznanica, ali dokumenti s pojedinostima o crkvenoj imovini sugeriraju da je sagrađena prije 1447. godine. Arheolozi vjeruju da je crkva izgrađena nešto prije uspona Osmanskog carstva vrlo vjerojatno u 13. stoljeću. Radovi na restauraciji crkve 1963. – 1964. godine doveli su do otkrića freske u kupoli crkve.