セーシェルに関する最も古い記録は、7世紀から8世紀ごろにアラブ人が来航したことである。1502年にはヴァスコ・ダ・ガマの第2回東インド航海において、アラブ人が活動しているのを目撃した[1]。しかし、当時はセーシェルに定住者は存在せず、無人島となっていた。

1742年にフランスは探検隊をセーシェルに送り込んだ。その際、その当時の首相[注釈 1]の名から諸島の名前を「セーシェル」、最大の島をマへ総督から「マヘ島」と名付けた。そして1756年にフランスが領有権を主張し、1768年にフランス領フランス島（現モーリシャス島）の属領として入植が開始され[2]、セーシェルは以後有人島となった[3]。

その後、1794年にはイギリス海軍が占領し、1814年にはパリ条約によってセーシェルはモーリシャスとともにイギリス領となった。1872年には民政総督府が置かれ、1903年にはモーリシャスから分離して単独の植民地となった。さらに、1948年には立法評議会選挙が実施されるなど、政治的自治は徐々に拡大していった[2]。1964年にセーシェル独立派のフランス＝アルベール・ルネが社会主義政党のセーシェル人民統一党を、イギリス領残留派のジェイムス・マンチャムが保守政党のセーシェル民主党を組織した。1971年にはセーシェル国際空港が開設されて他国からのアクセスが大幅に改善され、観光業発展の基礎が築かれた[4]。

1976年6月29日にイギリスから独立し、同時にイギリス領インド洋地域に属していたデロッシュ島、アルダブラ群島、ファーカー諸島がイギリスからセーシェルに割譲された[2]。新政府は民主党と人民統一党の連立政権となり、民主党のマンチャムが大統領に、人民統一党のルネが首相に就任した。しかし翌1977年にルネがクーデター（英語版）でマンチャムを追放して実権を握り、一党独裁制を敷いた。人民統一党は1978年にセーシェル人民進歩戦線と改称し、1979年には憲法を改正して正式に一党独裁となった[5]。その後、数度にわたってクーデター未遂が起きるなど政情不安が続く[6]一方で、ルネ政権は観光開発に力を入れ、経済は成長を続けた。

1991年に入ると民主化運動が盛んとなったためにルネ政権は再び複数政党制導入を表明し、マンチャムなど亡命していた指導者も帰国して、1993年には民主的な新憲法が発布された。同年、複数政党による民主選挙が行われたが、与党・人民進歩戦線は経済成長を評価されて33議席中25議席を獲得し、同時に行われた大統領選挙でもルネが勝利した[7]。ルネは2004年に引退し、副大統領だったジェイムス・ミッシェルが後継となった[8]。その後も人民党政権は継続したが、2016年の議会選挙で野党のセーシェル国民連合が議席の過半数を獲得し、人民党のダニー・フォール大統領とのねじれ現象が現出した（後述）。2020年10月には野党連合が大統領選挙、議会総選挙ともに勝利し、43年ぶりの政権交代が実現した。

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