ビジャ・エペクエンは、1920年代初めに開発された観光の町である[1]。エペクエン湖の塩水には治癒の効果があると考えられており、塩水浴リゾート地として観光客をひきつけたのである[2]。

まもなく、ブエノスアイレスとの間は鉄道で結ばれるようになった[2]。サルミエント鉄道 (Sarmiento Railway) がラーゴ・エペクエン駅 (es:Estación Lago Epecuén) に、またミッドランド鉄道 (es:Ferrocarril Midland de Buenos Aires) とスド鉄道 (es:Ferrocarril del Sud) は付近のカルウエ駅 (es:Estación Carhué) に旅客を運んでいた。

町の繁栄の頂点は1970年代であった[3]。1950年代から1970年代まで、11月から3月にかけての時期には2万5000人の観光客が訪れ、ロッジやゲストハウス、ホテル、商店など280にのぼる企業があった。1985年の水没時、ヴィラ・エペクエンの人口は約1,500人で[1]、5,000人以上の旅行者を受け入れる能力があった[1]。

 

 

気候変動によって、この地域には大量の雨が降るようになった[3][2]。1985年11月10日、湖水は町を守る堤防を越え、町は水没した[3]。居住することはできなくなり、その後再建されることもなかった。

その後も水位は徐々に上昇し、最も深い時期（1993年）には、町は10メートルの水底に沈んでいた[3]。

その後の気候の変化によって水位は低下し、2009年には水没していた町が再び現れるようになった[3]。

この町には今日（2011年現在）、ただ1人の住民であるパブロ・ノヴァク（Pablo Novak、1930年生まれ）が暮らしている。ノヴァクは、町を25年間覆っていた水が引いた2009年に自宅に戻った[3]。