Honmyo-ji (本妙寺) is een boeddhistische tempel van de Nichiren-sekte, Rokujōmon-ryū (六条門流), in Nishi-ku, Kumamoto, Japan. Het is de hoogste tempel van de sekte in Kyushu. In Honmyō-ji is het graf van Katō Kiyomasa, (1562–1611), een Japanse daimyō, bouwer van Kumamoto Castle en een toegewijd boeddhist van het Nichiren-boeddhisme.