Pierwsze ślady niewielkiej osady Cerén pochodzą z ok. 1200 roku p.n.e.[1] Ok. 200 roku n.e. została ona opuszczona z powodu wybuchu wulkanu Ilopango. Po około dwustu latach miejsce zostało na nowo zasiedlone przez rolniczą społeczność, jednak wybuch wulkanu Loma Caldera ok. 590 roku całkowicie ją pogrzebał. Badania wykazały, że wioska w przeciągu kilku godzin została pokryta grubą na 4-8 m warstwą popiołu, jednak ludność zdołała opuścić wioskę, gdyż żadne ciała nie zostały znalezione. Odkryto natomiast porzucone sprzęty domowe, ceramikę oraz resztki jedzenia[2].