Meczet Malindi to meczet w Stone Town na Zanzibarze w Tanzanii, położony w pobliżu portu. Pochodzi z lat 30. XIX wieku, ale prawdopodobnie został zbudowany na miejscu starszego meczetu, który mógł pochodzić z XVII wieku lub wcześniej. Niektóre przewodniki turystyczne twierdzą, że pochodzą z XV wieku.

Obecny meczet został zbudowany w latach 1834-1835/1250 AH przez Muhammada ben Abdulkadira al-Mansaby z wybrzeża Benadir w Somalii. Był bogatym kupcem na Zanzibarze od lat 20. do 40. XIX wieku. Budynek został dwukrotnie powiększony w 1841 i 1890 roku.

Ma kilka niezwykłych elementów architektonicznych, w tym minaret w kształcie stożka (jeden z zaledwie trzech minaretów tego kształtu w Afryce Wschodniej) i kwadratową platformę.