Foi transformada na segunda metade do século XV numa igreja da Orden de Calatrava. Em 1550, o cardeal Siliceo converteu-a numa beataria para prostitutas arrependidas. No século XVIII foi ocupada como quartel para as tropas da guarnição de Toledo. A meados do século XIX, o edifício foi declarado monumento nacional. Depois da guerra civil espanhola, um decreto real do governo entrega Santa María la Blanca à Igreja Católica.