Археологические раскопки сведетельствуют о наличии постоянного населения на протяжении как минимум 10 000 лет в этом районе[1].  Когда первые европейцы прибыли в южную часть п-ова Калифорния, они столкнулись с народом Перику́ (исп. Pericú) , который выживал за счет натурального питания, основанного на охоте и сборе семян, корней, моллюсков и других морских ресурсов. Они назвали это место Йенекаму.

Согласно рассказу Хацутаро, в книге «Кайгай Ибун» (написанной Маэкавой, Дзюнзо и Бунзо Сакаи па рассказу Хацутаро), когда он прибыл в Кабо-Сан-Лукас в мае 1842 года, там было всего два дома и около 20 жителей. Однако американские авторы, такие как Генри Эдвардс и Джон Росс Браун, утверждают, что основателем Кабо-Сан-Лукас был англичанин по имени Томас «Старый Том» Ричи.  Джон Росс Браун говорит, что Ричи прибыл туда примерно в 1828 году, а Эдвардс говорит, что он умер в октябре 1874 года. Фактическим основателем Кабо-Сан-Лукас был Киприано Кесенья (исп. Cipriano Ceceña) в 1788 году, прибывший из Эрмосильо, Сонора.  Согласно книге Пабло Л. Мартинеса, "Знакомый человек из Нижней Калифорнии" (исп. Guia Familiar de Baja California) 1700–1900.

В этом районе начала расти рыбацкая деревня.  В 1917 году американская компания построила плавучую платформу для ловли тунца, а десять лет спустя основала "Compañía de Productos Marinos S.A.", которая проработал несколько лет.