Виган расположен на острове, отделённом от основного массива суши тремя реками — Абра, Местисо и Говантес. Ещё до прихода испанцев население этой местности торговало с китайскими купцами. Сюда поступали различные товары из азиатских стран в обмен на золото, воск и другие товары, производимые народами горных районов. В двух письмах генерал-губернатора Гидо де Лавесариса к испанскому королю Филиппу II говорится :

Было бы лучше всего послать капитана Хуана де Сальседо с 70 или 80 солдатами для исследования земель илоканцев, на берегах реки, называемой Биган.

Испанцы прибыли сюда в 1572 году. Хуан де Сальседо основал город, который назвали Вилья Фернандина де Виган, в честь сына Филиппа II, принца Фердинанда.

Первоначально провинция, центром которой был Виган, объединяла территорию нескольких современных провинций. Это Южный и Северный Илокос, Ла-Унион, Абра и часть Горной провинции. В 1576 году с прибытием монахов-августинцев началась христианизация края. Здесь был размещён испанский гарнизон для контроля соседних территорий. Первоначально город был назван Вилья-Фернандина, затем Вилья-Фернадина де Виган, и в конце концов сохранилась лишь последняя часть. В XVII веке Виган был центром архиепископства Новая Сеговия.