Honmyō-ji (本妙寺) är ett buddhistiskt tempel för Nichiren-sekten, Rokujōmon-ryū (六条門流), i Nishi-ku, Kumamoto, Japan. Det är sektens högst uppsatta tempel i Kyushu. I Honmyō-ji finns graven för Katō Kiyomasa, (1562–1611), en japansk daimyō, byggare av Kumamoto-slottet och en hängiven buddhist inom Nichiren-buddhismen.