1874 beskådas klippboningarna för första gången av européer. Innan dess har bara mindre lämningar noterats. Det dröjer ändå många år innan alla större klippboningar hittas. I tidningen Durango Herald år 1890 föreslås första gången att Mesa Verde ska bli en nationalpark.

Området blev en nationalpark 29 juni 1906 och blev klassat som ett världsarv 6 september 1978.[1] Under sommaren 2002, led skogen svårt av stora skogsbränder och delar av parken stängdes. Alla områden i parken har sedan dess öppnats, men några områden uppvisar fortfarande skador från branden.

Svensken Gustaf Nordenskiöld anses vara den första vetenskapsmannen som besökte Mesa Verde. Arkeologer anser än idag att han gjorde ett föredömligt och noggrant arbete med att systematiskt dokumentera fyndplatserna. Nordenskiöld samlade ihop omkring 600 objekt som skickades till Sverige. Dessa återfinns idag i Nationalmuseum i Helsingfors. Några av fynden, gravgåvor och mänskliga kvarlevor, kommer att återlämnas till ursprungsbefolkningen och begravas nära fyndplatsen.[2] De 28 föremål som återlämnas visades på en specialutställning under vintern 2020.[3]