Yapı  San Marco Bazilikası'nın ön cephe kapısında bulunan beş kemerin birincisi (San Alipio kemeri). Lunnette (hilal şeklindeki duvar resmi)'te Marko'ya ait röliklerin getirilişini anlatan mozaik yer almaktadır. Mozaiktaki San Marco Bazilikası'nda 1204'te Constantinopolis'in hipodromundan çalınıp getirilen dört at heykeli de görülmektedir. Altında Venedik'i temsil eden kanatlı aslan, Markos Luka, Matta'yı temsil eden ve ellerinde incili tutan aslan, boğa, kartal ve insan (melek) motifleri yer almaktadır.

Yapı ilk olarak 828 yılında Venedikli tüccarlar Malamoccolu Bono ve Torcellolu Rustico'nun İskenderiye'den Evangelist Aziz Marko'nun kutsal emanetlerini çaldıklarında yapıldığı zaman Düka'nın Sarayı'nda geçici bir yapıydı. Yeni kilise 976 yılı isyanında yandı, 978 yılında ise yeniden inşa edildi ve 1063'ten beri günümüzdeki basilikanın ana şekline uygun çalışma tekrarlandı.

Basilika 1094 yılında kutsandı, aynı yıl güya Aziz Marko'nun vücudu bir sütun içinde Venedik Dükası Vitale Falier tarafından keşfedildi. Yapı ayrıca aşağı bir kuleyle birleşir (şimdi Aziz Marko'nun hazine odasıdır), bazılarınca Düka'nın Sarayının orijinal bir kısmı olduğuna inanılır.

13. yüzyılın ilk yarısı içinde kilisenin girişi (veya lobi alanı) ve yapının ön cephesi inşa edildi, mozaiklerin çoğu tamamlandı ve kubbeler daha yüksek odunla kaplandı, kubbeler Gotik mimari tarzında yeniden inşa edilen Düka'nın Sarayı'na uyum sağlaması açısından kurşunla kaplandı.

Ayrıca San Marco Bazilikası 2009 Kasım ayında piyasaya sürülen Assassin's Creed II adlı oyunda da aynı şekilde görünmektedir.