Tu viện được thành lập vào thế kỷ thứ 4, theo truyền thống của Gregory the Illuminator. Địa điểm này là một nơi phát sinh mở rộng trong một hang động vốn là thiêng liêng thời tiền Kitô giáo, do đó, một trong những cái tên đầu tiên được biết đến của nó là Ayrivank (Tu viện của hang động). Tu viện đầu tiên đã bị người Ả Rập phá hủy vào thế kỷ thứ 9.

Không có gì còn lại của các cấu trúc của Ayrivank. Theo các nhà sử học Armenia sống vào thế kỷ thứ 4, 8 và 10, tu viện bao gồm, ngoài các tòa nhà tôn giáo, các khu dân cư và dịch vụ được trang bị tốt. Ayrivank đã phải chịu đựng rất nhiều vào năm 923 bởi Nasr, một phó nhiếp chính của một người Ả Rập ở Armenia, người đã cướp bóc tài sản quý giá của tu viện, bao gồm các bản thảo độc đáo và đốt cháy các cấu trúc tuyệt vời của tu viện. Động đất cũng gây thiệt hại không nhỏ.

Mặc dù có những dòng chữ có niên đại từ những năm 1160, nhưng nhà thờ chính được xây dựng vào năm 1215 dưới sự bảo trợ của anh em Zakare và Ivane, các tướng của Nữ hoàng Tamar của Georgia, người đã lấy lại phần lớn Armenia từ tay Thổ Nhĩ Kỳ. Gavit, một phần tự do, một phần được chạm khắc trong vách đá, có từ trước năm 1225, và một loạt các nhà nguyện được đẽo vào đá có từ giữa thế kỷ 13 sau khi nơi này được hoàng tử Prosh Khaghbakian, chư hầu của người Kurd mua và là người sáng lập công quốc Proshian. Trong một thời gian ngắn, người Proshyan đã xây dựng các cấu trúc hang động mang lại danh tiếng lớn cho Geghard - nhà thờ hang động thứ hai, gia đình của zhamatun Papak và Ruzukan, một hội trường để tụ tập và nghiên cứu (sụp đổ vào giữa thế kỷ 20) cấu trúc tu viện. Khoang từ phía đông bắc của gavit trở thành lăng mộ Hoàng tử Prosh Khaghbakian năm 1283. Khoang liền kề đã khắc trên đá cánh tay của gia đình Proshian, bao gồm một con đại bàng với một con cừu trong móng vuốt. Một cầu thang W của gavit dẫn đến một phòng tang lễ được khắc vào năm 1288 cho Papak Proshian và vợ Ruzukan. Các hoàng tử Proshyan đã đào cho Geghard một hệ thống tưới tiêu vào thế kỷ 13. Vào thời điểm này, nó còn được gọi là Tu viện Bảy nhà thờ và Tu viện của Bốn mươi Bàn thờ. Xung quanh tu viện là những hang động và khachkars. Tu viện không còn tồn tại, nhà thờ chính được sử dụng để che chở đàn chiên của những người du mục Karapapakh vào mùa đông, cho đến khi được một vài nhà sư từ Ejmiatsin tái định cư sau cuộc chinh phạt của Nga. Được phục hồi cho mục đích du lịch nhưng bây giờ với sự hiện diện nhỏ của giáo hội, địa điểm này vẫn là một nơi hành hương chính.

Tu viện nổi tiếng vì các di tích mà nó lưu giữ. Di tích nổi tiếng nhất trong số này là ngọn giáo đã làm Chúa Kitô bị thương trên Thập giá, được cho là do Sứ đồ Thaddeus mang đến, từ đó có tên hiện tại là Geghard-avank ("Tu viện của ngọn giáo"), lần đầu tiên được ghi lại trong một tài liệu vào năm 1250. Điều này làm cho nó trở thành một nơi hành hương phổ biến cho các Kitô hữu Armenia trong nhiều thế kỷ. Thánh tích của các Tông đồ Andrew và John đã được quyên góp vào thế kỷ thứ 12, và những vị khách ngoan đạo đã kiếm được rất nhiều khoản trợ cấp về đất đai, tiền bạc, bản thảo, v.v., trong nhiều thế kỷ tiếp theo. Trong một trong những cấu trúc hang động; vào thế kỷ 13, là nơi từng sống của Mkhitar Ayrivanetsi, nhà sử học nổi tiếng người Armenia.

Không có tác phẩm nghệ thuật thực nghiệm nào còn tồn tại ở Geghard, ngoại trừ cây giáo huyền thoại (geghard). Trục có một tấm hình kim cương gắn vào đầu của nó; một cây thánh giá Hy Lạp với đầu nhọn được cắt xuyên qua tấm. Một trường hợp đặc biệt đã được thực hiện cho nó vào năm 1687, hiện được lưu giữ trong bảo tàng tu viện Echmiadzin. Vỏ bạc mạ vàng là một sản phẩm thủ công mỹ nghệ thông thường ở Armenia vào thế kỷ 17.