Missió San Carlos Borromeo del Río Carmelo, o Missió de San Carlos Borromeo de Carmelo, construïda per primera vegada el 1797, és una de les esglésies de missió catòliques més autènticament restaurades de Califòrnia. Situat a la desembocadura de Carmel Valley, Califòrnia, es troba al Registre Nacional de Llocs Històrics i és un Monument Històric Nacional.

Des del 1797 fins al 1833, Carmel Mission va ser la seu de totes les missions d'Alta Califòrnia. Va ser encapçalada per sant Juníper Serra des de 1770 fins a la seva mort, l'any 1784. També va ser la seu del presidente de les segones missions, el pare Fermín Francisco de Lasuén, que va ser l'encarregat de completar nou esglésies de missió més.

El 1833 els edificis i els terrenys de la missió van ser secularitzats pel govern mexicà. A mitjans del segle XIX, les estructures de la Missió del Carmel havien caigut en mal estat. La capella es va salvar de la destrucció total quan es va reconstruir el sostre el 1884. El 1886, la propietat de la missió va ser transferida d'un grup de franciscans a la diòcesi de Monterey. Des d'aleshores, Carmel Mission ha estat una parròquia dins d'aquesta diòcesi.

A partir de 1931, Harry Downie va començar a restaurar la missió i va treballar contínuament en el projecte durant els següents 50 anys. És l'única missió espanyola a Califòrnia que té el seu campanar i el seu campanar originals. Carmel Mission conté la primera biblioteca de l'estat.