Kota Puerto Princesa (bahasa Tagalog: [Lungsod ng Puerto Princesa] Error: {{Lang}}: text has italic markup (help)) merupakan nama kota di Filipina. Tepatnya di Provinsi Palawan. Kota ini merupakan ibu kota Palawan. Pada tahun 2010, dengan memiliki jumlah penduduk sebanyak 210.508 jiwa di 46.245 tempat tinggal. Kota ini memiliki luas wilayah 2.400 km². Dengan memiliki angka kepadatan penduduk sebesar 88 jiwa/km².

Situs UNESCO di kota ini ialah Taman Nasional Sungai Bawah Tanah Puerto Princesa.