쿠스코(스페인어: Cusco, 문화어: 꾸스꼬)는 페루 남동부 쿠스코주에 있는 도시이다. 80km 북서쪽으로 마추 픽추가 있으며, 안데스 산맥 사이의 해발 3,399m에 있다. 현재 인구는 약 42만 8천명이다.

쿠스코는 케추아어로 부엉이 바위(rock of the owl)를 의미하고 타완틴수유(Tawantinsuyu, 잉카 제국의 정식 명칭)의 수도이며, 문화의 중심지였다. 지금도 페루에서 가장 유수한 도시 중의 하나이다.