Missão San Carlos Borromeo del Río Carmelo, ou Misión de San Carlos Borromeo de Carmelo, construída pela primeira vez em 1797, é uma das igrejas missionárias católicas mais autenticamente restauradas em Califórnia. Localizado na foz de Carmel Valley, Califórnia, está no Registro Nacional de Locais Históricos e é um marco histórico nacional.

De 1797 a 1833, a Missão Carmel foi a sede de todas as missões da Alta Califórnia. Foi chefiada por São Junípero Serra de 1770 até sua morte em 1784. Foi também a sede do segundo presidente de missões, Padre Fermín Francisco de Lasuén, encarregado de completar mais nove igrejas missionárias.

Em 1833, os edifícios e terras da missão foram secularizados pelo governo mexicano. Em meados do século 19, as estruturas da Missão Carmelo estavam em mau estado. A capela foi salva da destruição total quando o telhado foi reconstruído em 1884. Em 1886, a propriedade da missão foi transferida de um grupo de franciscanos para a Diocese de Monterey. Desde então, a Missão Carmel é uma paróquia daquela diocese.

A partir de 1931, Harry Downie começou a restaurar a missão e trabalhou continuamente no projeto durante os 50 anos seguintes. É a única missão espanhola na Califórnia que possui seu sino e torre sineira originais. A Missão Carmel contém a primeira biblioteca do estado.