Високу синагогу (чеська: Vysoká synagoga) фінансував Мордехай Майзель, і вона була закінчена в 1568 році, того ж року, що й Єврейське місто Зал. Ймовірно, вона була створена за зразком Високої синагоги в Кракові, яка була побудована в 1556 році в Польщі. Будинок побудований за проектом П. Родера в стилі ренесансу (керівник — майстер Рада). Він був задуманий як місце проповіді для радників єврейської ратуші. У центрі були біми, оточені сидіннями. Мордехай Майзель подарував синагозі уламки Тори та срібні інструменти. Ліпна стеля була готичним ребристим склепінням.

У 1689 році його знищила велика пожежа. Синагогу було реконструйовано.

У 1883 році синагогу перебудував Й. М. Вертмюллер. Під час цієї модифікації фасад було спрощено до сучасного вигляду.

У 1907 році східний вхід було закрито, а новий вхід вийшов на Червону вулицю (Červená ulice).

Інші реконструкції були протягом 1961, 1974–79 та 1982 років.

Під час нацистського та комуністичного правління синагога була частиною Єврейського музею, і тут була виставка староєврейських книг.