Sinagoga e Lartë (Çekisht: Vysoká synagoga) u financua nga Mordechai Maisel dhe u përfundua në vitin 1568, në të njëjtin vit me qytetin hebre Salla. Ndoshta është modeluar sipas Sinagogës së Lartë, Kraków, e cila u ndërtua në 1556 në Poloni. Shtëpia është projektuar nga P. Roder në stilin e Rilindjes (ndërtuesi mbikëqyrës ishte mjeshtri Rada). Ai ishte projektuar si një vend predikimi për këshilltarët e bashkisë hebreje. Në qendër kishte bimah, të rrethuar me ndenjëse. Mordechai Maisel i dha sinagogës copa Tora dhe vegla argjendi. Tavani i llaçit ishte me qemer me brinjë gotike.

Në 1689 u shkatërrua nga Zjarri i Madh. Sinagoga u rindërtua.

Në 1883 sinagoga u rindërtua nga J. M. Wertmüller. Gjatë këtij modifikimi fasada u thjeshtua në pamjen moderne.

Në vitin 1907 hyrja lindore u mbyll dhe një hyrje e re u bë përballë Rrugës së Kuqe (Červená ulice).

Rindërtime të tjera ishin gjatë viteve 1961, 1974–79 dhe 1982.

Gjatë sundimit nazist dhe komunist, sinagoga ishte pjesë e Muzeut Hebraik dhe kishte një ekspozitë me libra të vjetër hebraik.